В конце августа 2017 Арбитражный суд Башкирии признал реорганизацию «Башнефти», которую в 2014-ом провели являвшиеся тогда собственниками компании АФК «Система» и «Система-Инвест», методом неправомерного вывода активов.

23 июня суд по ходатайству «Роснефти» наложил арест на принадлежащие АФК «Система» 31,76% акций МТС, 100% акций «Медси» и 90,47% акций БЭСК.

«Суд постановил определение суда оставить без изменения, жалобу — без удовлетворения», — сообщила судья. «Система» пробовала обжаловать судебные решения, в том числе по части принятия обеспечительных мер в виде ареста активов, однако получила отказ как в башкирском суде, так и в апелляционном челябинском — оба оставили жалобу ответчика, заявлявшего о падении акций на московской бирже, без удовлетворения. 10 августа арбитраж отказал в переносе дела «Роснефти» и АФК «Система» в другой суд, с чем заключительная не дала согласие и попробовала обжаловать решение. По существу жалобы он объяснил, что в Арбитражном суде Башкирии не было возможности сформировать законный состав суда для разрешения дела, поэтому Восемнадцатый арбитражный апелляционный суд должен определить суд первой инстанции, который сумеет рассмотреть дело.

В начале осени 2014 г. Генеральная прокуратура РФ подала иск об аресте принадлежащих АФК «Система» акций «Башнефти» и о возврате их в госсобственность. Поэтому необходимо закончить производство по жалобе.

С 2005 года по 2014 год «Башнефть» входила в состав АФК «Система» Владимира Евтушенкова, после этого была возвращена в государственную собственность.

Суд взыскал в пользу «Башнефти» 136,3 миллиарда рублей при общей сумме иска в 170,6 миллиарда рублей.

Порядка 50% акций «Башнефти» были приватизированы к середине осени 2016-ого года, новым собственником активов стала «Роснефть». «Роснефть «ROSN изучает решение суда по «Башнефти «BANE, не исключает корректировки суммы взыскания с АФК «Система «AFKS вышестоящей инстанцией, объявил руководитель крупнейшей русской нефтяной компании Игорь Сечин. Позднее, после оферты миноритариям, «Роснефть» стала контролировать 57,7% уставного капитала «Башнефти».